L'école La Mission a ouvert ses portes en septembre 1995 avec une population de 33 élèves de la maternelle à la 3e année sous la direction de Sylvie Bergevin. L'école était située dans l'édifice du bureau central de la commission scolaire protestante de St-Albert.
De 1996 à 2002, sous la direction de Mme Stella Rouleau, les niveaux 4e à 7e ont été ajoutés.
À la fin de l'année scolaire 2002-2003, sous la direction de Mme Monique Holm, il y avait 78 élèves de la maternelle à la 7e année.
En septembre 2003, la 8e année a été ajoutée et en septembre 2004, la 9e année.
À ses débuts, l’école desservait surtout la population urbaine de St. Albert. De nos jours, l’école dessert aussi les villes de Spruce Grove, Stony Plain et les communautés de Calahoo, Villeneuve, le nord-ouest d’Edmonton et le comté de Sturgeon.
Tout au long de ces années, les parents, le personnel de l'école ainsi que le conseil scolaire ont travaillé fort pour poursuivre leur grand rêve d'avoir leur propre école. Finalement, en avril 2001, le gouvernement de l'Alberta annonce la construction d'une nouvelle école francophone pour Saint-Albert.
La construction débute en janvier 2002. Le déménagement au 46 Heritage Drive a eu lieu le 14 octobre 2003.
En septembre 2006, sous la direction de M. Claude Viel, la population a augmenté à 160 élèves de la maternelle à la 9e année.
En septembre 2009, l'école La Mission redevient uniquement une école élémentaire avec l'ouverture de l'école Alexandre-Taché dans la ville de Saint-Albert qui offre une programmation de la 7e à la 12e année.
En septembre 2015, sous la direction de Mme Nancy Bélanger, la population a augmenté à 190 élèves de la maternelle à la 6e année.
En septembre 2017, sous la direction de M. Stéphan Charron, la population a augmenté à 220 élèves.
En septembre 2018, sous la direction de Mme Marielle Perich, la population compte 250 élèves.
Dû à une forte croissance d’effectifs à l’école La Mission au cours des dernières années, le Conseil scolaire a adopté une proposition confirmant la reconfiguration des niveaux scolaires entre les écoles La Mission et Alexandre-Taché. Dès la rentrée scolaire 2020, les élèves de la 5e et 6e année iront à l’école Alexandre-Taché. L’école La Mission deviendra une école de la maternelle à la 4e année avec un programme de prématernelle.
Suite à l'annonce du départ à la retraire de Marielle Perich, Madame Nancy Bélanger effectu un retour aux sources pour l'année scolaire 2022-2023. L'ouverture d'une nouvelle école à Stony Plain apporte des changements à l'aire de fréquentation de l'école. Nous débutons l'année scolaire avec 165 élèves.
Dès septembre 2024, l'école La Mission offrira un programme de la maternelle à la 5e année en débutant l'année scolaire avec 225 élèves.